دراسة الماجستير في تخصص هندسة تقنيات الاجهزة الطبية يمتد على مدى عامين دراسيين. يتم تقديم الكورسات الاكاديمية على أساس معيار يسمح للطلبة بالتركيز على مجالات الاختصاص الدقيق في تخصص هندسة تقنيات الاجهزة الطبية. اذ هناك 12 مادة دراسية في العام الدراسي الواحد وكل مادة تستمر لمدة 15 اسبوعا. يأخذ طلبة الدراسات العليا كورسات من فصلين دراسيين ، وستة مواد مقررة لكل كورس.